2019年学院有一级学科5个（基础医学，特种医学，生物医学工程，生物学，药学）；博士、硕士学位授权点各23个，博士后流动站4个（基础医学、特种医学、生物医学工程、生物学），本科专业2个（基础医学、法医学），均为国家特色建设专业。学院有教育部“双一流”建设学科1个（基础医学），国家重点学科1个（法医学），“211工程”重点建设学科2个（病理生理学、法医学），四川省重点学科5个（人体解剖与组织胚胎学、生理学、生物化学与分子生物学、病理生理学、法医学）。有卫生部重点实验室1个（时间生物学），四川省国际科技合作基地1个（应激医学示范型国际科技合作基地），四川省重点实验室3个（医学分子生物学开放实验室、干细胞应用研究中心、疾病基因组与法医学实验室）。学院于2008年被教育部批准为国家“基础医学科学研究和教学人才培养基地”。有国家优秀教学团队1个（法医学）。